非典型猪瘟则采集组织脏器(如扁桃体 、淋巴结等)和血清送到有条件的实验室进行诊断和鉴别。临床上出现以高热 、皮肤出血等败血症为特点的急性猪瘟时，应注意与急性猪丹毒 、最急性猪肺疫、败血性链球菌病 、急性猪副伤寒和弓形虫病等疾病相区别 。
夏季多发 ，呈地方流行性 ，病程短，在猪群中传染较慢 ，发病率和死亡率比猪瘟低。体温很高 ，但仍有一定食欲。皮肤上的红斑指压退色，病程较长时皮肤上有紫红色疹块 。眼睛清亮有神，步态僵硬 ，很少发生腹泻。死后剖检，胃和小肠有严重的出血性炎症 ，脾脏肿大 ，呈樱桃红色 ，淋巴结和肾淤血肿大 ，淋巴结切面不呈大理石斑纹 ，大肠粘膜无显著变化 。病原为猪丹毒杆菌，青霉素治疗有效。
最急性猪肺疫
夏季或气候、饲养条件剧变时多发 ，呈流行性 ，发病率和病死率比猪瘟低 ，咽喉部急性肿胀 ，呼吸困难 ，口鼻流泡沫 ，有咳嗽，皮肤发红 ，或有少数出血点。剖检肉眼可见咽候部肿胀出血，肺充血水肿，颌下淋巴结出血、切面呈红色，脾不肿大 。病原为猪巴氏杆菌，抗菌药物治疗有效 。
败血性链球菌病
多见仔猪发病。常有多发性关节炎和脑膜炎症状 ，病程短 。剖检肉眼可见各器官充血 、出血明显 ，心包液增量 ，脾肿大 。有神经症状的病例，脑和脑膜充血 、出血 ，脑脊髓液增量 、浑浊，脑实质有化脓性脑炎变化 。病原为溶血性链球菌 ，抗菌药物治疗有效 。
急性猪副伤寒
多见2～4月龄猪发病，在阴雨连绵季节多发，一般呈散发。先便秘后下痢 ，有时粪便带血，有结膜炎，胸腹部皮肤呈蓝紫色。剖检肠系膜淋巴结显著肿大，肝可见黄色或灰色小点状坏死 ，大肠有溃疡 ，脾肿大 。病原为猪沙门氏菌，氯霉素和磺胺类药物治疗有效。
弓形虫病
主要发生于架子猪，流行于夏秋炎热季节。剖检脾肿大，肝有散在出血点和坏死点 ，淋巴结肿大 ，有出血点和坏死点 ，脑实质充血 、水肿、坏死 ，可区别于猪瘟 。病原为弓形虫，磺胺类药物治疗有效 。
此外 ，猪瘟引起母猪的繁殖障碍应注意与猪细小病毒病 、猪伪狂犬病 、猪乙型脑炎、猪繁殖与呼吸综合症 、弓形体病、猪钩端螺旋体、猪衣原体及猪布鲁氏菌病等疾病相区别 。
